Rosalind and Morris
Goodman Cancer
Institute Principal
Investigators
We study the logics and biological impacts of gene silencing by RNA on the regulation of genes in development, physiology, and cancer.
Small non-coding RNAs such as microRNAs and siRNAs control gene expression by a diversity of mechanisms that affect messenger RNA transcription, translation, and stability. We integrate a full range of experimental strategies and models to understand how they function and how their defects lead to cancer.
What we are
currently
working on
The Duchaine Lab research focuses on RNA-mediated interference (RNAi) pathways, including endogenous RNAi and microRNA-mediated silencing, and their impact on the regulation of gene networks.
Our research program has two main aims:
Our research program has two main aims:
- The identification of the functions of small RNAs in development and cancer.
- The understanding of the molecular basis of the RNAi phenomena.
- La décapitation et la dégradation de l'ARNm dans les fonctions des miARN et le développement Les miARN réduisent l'expression de leurs cibles d'ARNm par une combinaison de répression de la traduction et de déadénylation, de décapitation et de dégradation. La contribution de chaque mécanisme dépend en partie du contexte cellulaire. Nous étudions comment diverses protéines activateurs de la décapitation régulent la fonction de Dcp2, et comment leurs interactions influencent le développement. À cette fin, nous utilisons une combinaison d'ingénierie génomique, d'imagerie, de biochimie et de génétique moléculaire dans le nématode C. elegans. mRNA decapping and decay in the functions of miRNAs and development miRNAs silence their mRNA targets through a combination of translational repression and deadenylation, decapping, and degradation. The contribution of each mechanism is partially dependent on cellular context. We are studying how various decapping activator proteins regulate Dcp2 function, and how their interactions impact development. Towards this, we use a combination of genome engineering, imaging, biochemistry, and molecular genetics in the nematode C. elegans.
- Mécanismes et fonctions de l'ARNi nucléaire Les voies d'interférence de l'ARNi nucléaire ont des impacts étendus sur l'organisation du génome, la ségrégation des chromosomes et la protection contre les virus et les éléments transposables. Nous utilisons l'organisme modèle C. elegans pour acquérir une compréhension biochimique des mécanismes qui relient les Argonautes aux modifications épigénétiques héréditaires en utilisant une combinaison de génétique, de génomique, de protéomique et de biochimie.
Lewis et al. ont identifié une famille de protéines interagissant avec l'Argonaute nucléaire (ENRI-1, ENRI-2 et ENRI-3) qui contrôlent la force et la spécificité des cibles de l'ARNi nucléaire chez C. elegans. Mechanisms and functions of nuclear RNAi Nuclear RNAi interference pathways have wide-ranging impacts on genome organization, chromosome segregation, and protection from viruses and transposable elements. We use the model organism C. elegans to gain biochemical insight into the mechanisms that link Argonautes with heritable epigenetic changes by using a combination of genetics, genomics, proteomics and biochemistry.
Lewis et al. identified a family of nuclear Argonaute-interacting proteins (ENRI-1, ENRI-2, and ENRI-3) that control the strength and target specificity of nuclear RNAi in C. elegans.
- Répression traductionnelle médiée par les miARN Les contributions de la répression traductionnelle par rapport à la dégradation de l'ARNm dans le silence médié par les miARN varient en fonction du type cellulaire et de l'organisme. Nous avons identifié la protéine contenant le domaine GYF, GYF-1, comme le premier effecteur direct de la répression traductionnelle médiée par les miARN et démontrons que l'inhibition de la traduction est plus importante pour la fonction de certains, mais pas de tous les miARN. miRNA-mediated translational repression The contributions of translational repression versus mRNA decay in miRNA-mediated silencing differ depending on the cell type and organism. We identified the GYF domain-containing protein GYF-1 as the first direct effector of miRNA-mediated translational repression and show demonstrate that inhibition of translation is more important for the function of some, but not all, miRNAs.
- Professor
Rosalind and Morris Goodman Cancer Institute
Department of Biochemistry
Faculty of Medicine and Health Sciences
McGill University - Chair, Department of Biochemistry
- Director, McGill Centre for RNA Sciences
Our team
Caroline Thivierge Assistant.e de recherche Research Assistant 
Hsin Wei (Cynthia) Tseng Étudiant.e au doctorat PhD Student 
Elva Vidya Étudiant.e au doctorat PhD Student 
Rania Leventis Technicien.ne en chef.fe de recherche Chief Research Technician
Major discoveries
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